Probablemente, sí. Pero no creo que debas tirarlas ¿que número tienes?(es broma)
Dependiendo de la zapatilla y del tipo de pie. Si es una zapatilla adecuada para ti, es importante hacer un periodo de adaptación, es decir, no irte a entrenar el primer día para estrenarlas.
Ponertelas primero para estar en casa, luego salir a andar, luego un poco más e ir viendo como va respondiendo tu pie. Si sigue molestando puede que no sean las zapatillas más adecuadas para ti.
Dejalas unos días descansar, a las zapatillas y a tu pies, y cuando no tengas molestias empieza la progresión a ver que tal. Aunque si ya lo has hecho de un principio...