Dolor en rodilla

Hola. Os cuento:
ANTECEDENTES: Resulta que hace un par de semanas hice la media maratón de Madrid (2:03), la semana siguiente descansando casi entera (bicicleta el domingo, 25 km) y me preparo mentálmente para mi nuevo entreno.
Lo comienzo el 15 con unos ejercicios de musculación, que el que mas relacionado con mi dolencia puede ser las zancadas o lunges, el martes series cañeras para mi nivel, 12X400 en 4:20 el km, miércoles descanso y jueves 11 km con 5 km centrales dándole cerita (por encima de mi nivel de un 10.000 km). Viernes con rodilla izquierda con dolores y la derecha algo. El sábado desaparecen los dolores de la izquierda pero se quedan los de la derecha.
Resulta que hace como 8 meses, estaba subiendo una cuesta y me puse a apretar, dando "patadas" contra el suelo fuertes, en eso escucho un pequeño "crack" de mi rodilla derecha. Nunca me ha molestado mucho hasta ahora. Si alguien me puede decir lo que puede ser o recomendarme algún médico o Físio lo agradezco. Soy de Madrid, aunque a diario trabajo en Zaragoza.
Acojonado es poco como estoy, además, noto que me duele bastante mas al subir escaleras que al andar.